化石：从考古“废料”进行DNA测序

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化石：从考古“废料”进行DNA测序

本期Scientific Reports杂志上介绍了用于通过“古DNA”(aDNA)测序来分析大块骨头样本内单一不明碎片的一个新的快速方法。骨头的小碎片常见于考古和古生物挖掘坑中，但会难以识别，而单一样本的aDNA分析也会是昂贵的和费时的。

Michael Bunce及同事提出一个被称为“bulk-bone”的方法。采用该方法，他们从骨头粉末的混合样本中提取和放大时间远之距今大约46,000年前的aDNA。每个样本含有来自在澳大利亚两个考古点（其名称分别为Devil’s Lair 和 Tunnel Cave）的15个沉积层之一内所发现的50-150个化石碎片的材料。他们对提取的aDNA进行筛选，以寻找可放大的线粒体DNA，后者随后采用高吞吐量测序方法（一种“元条码”方法）进行测序。然后，作者完成了一项分类分析，它表明这些样本含有来自一系列哺乳动物、鸟类和爬行类的DNA。

对来自发掘点和测试坑的大块骨头样本进行快速的、高性价比的分析，同时又不会损坏在形态上重要的样本，这种方法对考古学家和古生物学家来说是一个有价值的工具。这些结果对给这种分析带来希望的一个方法做了初步演示，并且有可能帮助从原本会被扔掉的样本中揭示有关过去生物多样性的信息。然而，还需要进一步的工作，来可靠地逐步推断有关遗传多样性的信息， 并将类别鉴定提高到物种水平。